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1、E100是一款具有卓越光學性能，合理人機學設計的正置顯微鏡。E100采用了尼康獨有的CFI無限遠光學系統，并對色差和場曲進行校正，工作距離更長，數值孔徑更高。新的BE平場消色差系列物鏡專為E100設計，確保在各個放大倍數下得到清晰明亮的圖像。

2、數碼照相系統帶有位置指示標簽的聚光器：聚光器上帶有孔徑光闌和4x、10x、40x、60x、100x物鏡的位置指示標簽，確保簡單快速地切換物鏡，得到完美的圖像。

3、同軸粗/微調：同軸粗/微調旋鈕位于桌平面高度，調焦旋鈕和載物臺手柄采用人機學設計，與操作者的距離相同，可以在正常坐姿下輕松進行調節。另外粗調的扭矩也可以調節。

4、更換簡便的鹵素燈：長壽命6V-20W鹵素燈可以調節到6V，更換非常簡便。

5、便于運輸和保管：顯微鏡機身設計緊湊，重量很輕，只需一個儲存箱就可以輕松實現E100的運輸和保管。

6、相差附件：使用相差環可以在10x和40x觀察到相差圖像。當相差環置于光路中時孔徑光闌自動打開。另外有100x的相差環和10x、20x、40x物鏡的暗場環等可選附件。

7、反射鏡組件：在沒有電源時可以使用鏡面單元。用反射鏡組件替換場鏡的操作非常簡便。

8、新型物鏡：尼康研發的新型CFI BE平場物鏡的特點是對整個視場的場曲和色差進行特殊校正，專用于E100。在所有放大倍數下都可以得到清晰明亮的圖像。

9、防霉設計：在物鏡、目鏡和目鏡筒中使用防霉涂層和防霉條，避免在高濕度的環境中使用產生霉變。

10、雙目和三目鏡筒：E100采用Siedentopf型目鏡筒，保證精確的目鏡筒長度。有雙目和三目兩種型號。數碼相機可以聯機在三目鏡筒上使用。

11、舒適觀察：目鏡筒的傾斜角為30°，在正常坐姿下可以舒適地觀察樣本。通過簡單擺動目鏡筒的前部，使用者可以調節眼點高度達34mm，找到最適合的觀察高度。另外瞳間距調節和屈光度調節使之適用于多數操作者。

12、機械載物臺：內置載物臺可以控制XY軸的行程。載物臺附件包括載玻片標本夾。